Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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