Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm3415J3QMS8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3415J3QMS8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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