Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm3336J3QMQ6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm3336J3QMQ6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm3336J3QMQ6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm3336J3QMQ6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm3336J3QMQ6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3336J3QMQ6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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