Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Bbip1J3QMK2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms