Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20828J3KMI7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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