Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp408H7BX78 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp408H7BX78 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms