Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms