Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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