Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms