Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
R3hdm1E9Q9Q2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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R3hdm1E9Q9Q2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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R3hdm1E9Q9Q2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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R3hdm1E9Q9Q2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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