Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ccdc71lE9Q4T4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccdc71lE9Q4T4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc71lE9Q4T4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ccdc71lE9Q4T4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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