Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt78E9Q0F0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms