Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms