Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms