Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms