Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf217D3YYI7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf217D3YYI7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf217D3YYI7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms