Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Phf11bB4XVQ1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Phf11bB4XVQ1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Phf11bB4XVQ1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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