Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rd3lB2RV38 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rd3lB2RV38 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rd3lB2RV38 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rd3lB2RV38 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rd3lB2RV38 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rd3lB2RV38 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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