Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprbB2RU80 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprbB2RU80 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprbB2RU80 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprbB2RU80 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms