Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms