Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Grik3B1AS29 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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