Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms