Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprfA2A8L5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprfA2A8L5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprfA2A8L5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprfA2A8L5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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