Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm2A2A7B5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms