Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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