Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms