Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms