Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms