Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms