Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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