Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms