Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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