Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SrfQ9JM73 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SrfQ9JM73 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SrfQ9JM73 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SrfQ9JM73 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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