Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclk1Q9JLM8 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms