Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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FancaQ9JL70 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FancaQ9JL70 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms