Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms