Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Trim39Q9ESN2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Trim39Q9ESN2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Trim39Q9ESN2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trim39Q9ESN2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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