Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms