Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp29Q9ES63 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms