Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc97Q9DBT3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc97Q9DBT3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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