Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmigd1Q9D7L8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms