Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms