Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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