Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Borcs8Q9D6Y4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Borcs8Q9D6Y4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Borcs8Q9D6Y4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Borcs8Q9D6Y4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Borcs8Q9D6Y4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Borcs8Q9D6Y4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms