Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syce1Q9D495 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms