Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms