Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exosc7Q9D0M0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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