Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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