Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms