Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms